Вы можете указать несколько типов цен для товара. Например, у вас есть розничные клиенты, клиенты, работающие по мелкому и по крупному опту.
Сперва заведите нужные типы цен в настройках интернет-магазина.

После этого в настройках для товаров укажите цены для каждого из типов.

Теперь осталось только назначить нужным клиентам нужный тип цен в кабинете администратора магазина, и они будут видеть свою цену.

Вы можете массово изменять цены разных типов через загрузку csv-файла.